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Pare che le mandorle siano da raccomandare oltre che per i loro benefici effetti sull'ipercolesterolemia e sul diabete, anche per le loro potenzialità come prebiotici. In particolare sarebbe la farina di mandorle ad avere un effetto prebiotico sulla flora intestinale. E tra l'altro se private della loro parte lipidica le mandorle non avrebbero l'effetto prebiotico che quindi sarebbe proprio legato al loro contenuto lipidico. Per il momento gli esperimenti sono stati effettuati su colture in vitro di batteri fecali, nelle quali si è evidenziato lo sviluppo di microflora benefica. Tuttavia i ricercatori auspicano a breve buoni risultati anche sull'intestino umano in vivo.
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